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细胞STR(ShortTandemRepeat)鉴定是一种常用的分子生物学技术,可以用于确定细胞系的身份和纯度。STR是指短串联重复序列,即由2-6个碱基组成的重复序列。在人类基因组中,存在许多这样的STR位点,并且不同个体之间的STR位点序列也存在差异。利用PCR扩增这些位点,可以得到一个由不同长度的DNA片段组成的电泳图谱,称为STR分型图谱。比较不同样本之间的分型图谱可以确定它们是否来自同一来源。关于细胞STR,北京清析技术研究院可提供如下检测项目:
1、小鼠细胞STR鉴定
细胞沉淀样本:收集细胞沉淀计数
细胞基因组DNA提取:基因组DNA提取、琼脂糖凝胶电泳、微量紫外分光光度计检测浓度
9个STR位点扩增
STR基因分型结果:将3730电泳片段转换为重复数
STR数据库比对:DS MZtools整合
2、人源细胞STR鉴定
细胞沉淀样本制备:收集细胞沉淀
细胞基因组DNA提取:基因组DNA提取、琼脂糖凝胶电泳、微量紫外分光光度计检测浓度
21个STR位点扩增
STR数据库比对
检测方法
1、提取DNA
将待检测细胞系中的DNA提取出来,并通过比色法或荧光法测量其浓度和纯度。
2、PCR扩增
选取一组标准化的STR位点进行PCR扩增,通常包括16个核心位点和1个性别鉴定位点。PCR反应体系包括模板DNA、引物、dNTPs、Taq聚合酶等成分。
3、电泳分离
将PCR产物通过聚丙烯酰胺凝胶电泳分离,并在荧光染料或银染剂下可视化。
4、数据分析
将样本的STR分型图谱与数据库中的参考样本进行比对,确定其身份和纯度。常用的数据库包括ATCC、DS MZ、JCRB等。
检测周期
到样后7-10个工作日(可加急),根据样品及其检测项目/方法会有所变动,具体需咨询工程师。
检测流程
1、沟通需求(在线或电话咨询);
2、寄样(邮寄样品支持上门取样);
3、报价(根据检测的复杂程度进行报价);
4、签约(签订合同和保密协议);
5、完成检测(检测周期会根据样品及其检测项目/方法会有所变动,出具检测报告,售后服务)。